MDM a ouvert un programme de santé communautaire à la demande des communautés indiennes, et avec elles, MDM travaille à l'amélioration de leur santé.
Des promoteurs de santé et des accoucheuses traditionnelles ont été formés.
Pour lutter contre la malnutrition chronique des enfants, une supplémentation régulière à base d'aliments traditionnels à haute valeur énergétique est distribuée.
Une fondation de sante de droit équatorien, Jambi Runa, reconnue par le Ministère de la Santé, a été constituée. Elle est composée et dirigée par les communautés.
MDM a aussi engagé des programmes communautaires de développement. Dans des potagers, les populations apprennent à cultiver les plantes utilisées lors de la supplémentation alimentaire.